More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2942 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  497  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  75.6 
 
 		 251 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  74.5 
 
 		 251 aa  380  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  72 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  72.8 
 
 		 256 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  73.2 
 
 		 254 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  74.9 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  76.1 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  75.6 
 
 		 251 aa  354  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  75.7 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  69.76 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  69.35 
 
 		 262 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  72.8 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  70.4 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  65.16 
 
 		 259 aa  345  5e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  66 
 
 		 251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  69.48 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  65.6 
 
 		 251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  64.4 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  66 
 
 		 251 aa  334  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  64.94 
 
 		 271 aa  334  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  65.06 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 281 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 281 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  65.46 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  66.27 
 
 		 262 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  65.2 
 
 		 251 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  69.2 
 
 		 273 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  62.4 
 
 		 251 aa  325  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  63.2 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  55.1 
 
 		 255 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  60.16 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  61.6 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  44.76 
 
 		 267 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  45.08 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  41.53 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.52 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  43.73 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  36.59 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  41.13 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  35.51 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  37.3 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  36.93 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  38.06 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  41.74 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  35.22 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  36.95 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  39.53 
 
 		 259 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  44.05 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  37.04 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  36.07 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  36.84 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  41.57 
 
 		 277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  34.65 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  35.22 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>