More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1229 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  50.92 
 
 		 270 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  55.89 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  53.85 
 
 		 302 aa  268  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  46.21 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  49.23 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  49.06 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  49.01 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  47.24 
 
 		 259 aa  214  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  48.02 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  49.21 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  43.64 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  49.6 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  46.39 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  46.39 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  46.25 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  46.67 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  46.83 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  46.27 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  46.83 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  46.83 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  46.83 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  46.22 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  45.74 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  46.48 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  47.45 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  43.31 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  49.08 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  50 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  46.8 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  44.98 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  46.33 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  46.33 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  44.22 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  45.63 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  43.6 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  46.22 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  36.58 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  38.7 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  44.66 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.9 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  35.83 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  37.8 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0280  ABC-2 type transporter  41.43 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  36.22 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  35.02 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  36.14 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  36.03 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  37.4 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  36.33 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  36.25 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  35.43 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  31.52 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2287  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  33.98 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  36.29 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  35.69 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  36.58 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  35.08 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  35.22 
 
 		 253 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>