More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6150 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  100 
 
 		 253 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  84.98 
 
 		 253 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  86.17 
 
 		 253 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  79.76 
 
 		 253 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  78.57 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  79.05 
 
 		 255 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  78.97 
 
 		 253 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  77.78 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  75.1 
 
 		 253 aa  400  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  74.7 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  75 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  73.91 
 
 		 253 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  74.31 
 
 		 253 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  72.33 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  72.33 
 
 		 259 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  73.81 
 
 		 253 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  74.6 
 
 		 253 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  73.81 
 
 		 253 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  74.31 
 
 		 253 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  71.94 
 
 		 259 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  72.73 
 
 		 253 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  72.73 
 
 		 256 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  73.12 
 
 		 253 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  73.12 
 
 		 253 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  73.12 
 
 		 253 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  70.75 
 
 		 253 aa  380  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  71.83 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  71.43 
 
 		 253 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  71.83 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  71.83 
 
 		 256 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3138  ABC-2 type transporter  70.24 
 
 		 253 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00549881  normal  0.763555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  72.33 
 
 		 259 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  68.65 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  72.62 
 
 		 253 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  71.43 
 
 		 253 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  69.84 
 
 		 253 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1658  ABC-2 type transporter  70.75 
 
 		 255 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  65.87 
 
 		 253 aa  364  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  71.03 
 
 		 253 aa  362  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  68.25 
 
 		 253 aa  362  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03055  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  69.17 
 
 		 253 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  68.38 
 
 		 253 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2408  ABC-2 type transporter  71.83 
 
 		 253 aa  358  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  68.25 
 
 		 253 aa  358  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  68.25 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2649  ABC-2 type transporter  73.81 
 
 		 253 aa  353  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  65.87 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  65.87 
 
 		 253 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  60.71 
 
 		 255 aa  323  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  61.11 
 
 		 253 aa  321  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2013  ABC-2 type transporter  62.85 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  41.77 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  39.76 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  38.71 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.65 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  38.8 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  37.9 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  39.52 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  39.52 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  39.52 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  39.52 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  39.52 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  40.42 
 
 		 271 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  37.34 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  40.66 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1157  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0839963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  36.25 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  35.46 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  37.08 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  37.2 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  37.45 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>