More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0401 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  56.2 
 
 		 270 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  55.81 
 
 		 270 aa  285  5.999999999999999e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  53.85 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  51.31 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  49.81 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  48.45 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  48.3 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  49.22 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  45.62 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  47.79 
 
 		 251 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  44.57 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  47.39 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  45.65 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  45.65 
 
 		 273 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  45.29 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  46.59 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  46.77 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  47.18 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  47.98 
 
 		 251 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  44.61 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  44.61 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  44.62 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  42.46 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  44.8 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  46.37 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  44.31 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  45.6 
 
 		 250 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  45.6 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  43.65 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  44.4 
 
 		 251 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  43.78 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  47.75 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  44.9 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 271 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  40.73 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  36.61 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  38.15 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  35.71 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  45.97 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  36.11 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  38.28 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  34.13 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  33.6 
 
 		 257 aa  172  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.92 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  36.9 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  33.99 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  35.77 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  42.46 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  34.13 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  34.13 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  41.9 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  37.85 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  38.67 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  39.35 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  34.71 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>