More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2743 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  68.8 
 
 
259 aa  359  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  67.2 
 
 
251 aa  344  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  66.8 
 
 
254 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  66.14 
 
 
251 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  65.74 
 
 
251 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  67.33 
 
 
251 aa  337  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  67.6 
 
 
273 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  65.74 
 
 
251 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  68.8 
 
 
271 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  67.6 
 
 
281 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  67.6 
 
 
281 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  67.33 
 
 
273 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  66.14 
 
 
251 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  65.46 
 
 
262 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  65.86 
 
 
262 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  65.74 
 
 
251 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  68.11 
 
 
254 aa  326  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  62.95 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  66.4 
 
 
262 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
251 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  65.74 
 
 
273 aa  317  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
251 aa  315  5e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  66.93 
 
 
251 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  65.74 
 
 
251 aa  311  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  62 
 
 
262 aa  311  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  64.8 
 
 
250 aa  309  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  65.2 
 
 
251 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  67.33 
 
 
251 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  56.63 
 
 
255 aa  291  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  62.4 
 
 
251 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  57.72 
 
 
268 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  57.72 
 
 
268 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 
267 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  44 
 
 
274 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  44.76 
 
 
270 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 
270 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  44.22 
 
 
273 aa  191  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  41.94 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  43.08 
 
 
292 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  44 
 
 
302 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  44.05 
 
 
277 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 
257 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.1 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  43.78 
 
 
290 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 
260 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 
256 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 
256 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 
256 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 
256 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  38.06 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  37.35 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 
256 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
256 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  38.68 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  38.68 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  38.68 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  38.68 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 
276 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  34.54 
 
 
256 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  37.2 
 
 
258 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 
258 aa  169  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  38.65 
 
 
253 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 
253 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 
258 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  35.25 
 
 
253 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 
256 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  36.55 
 
 
257 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 
262 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  35.46 
 
 
257 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  34 
 
 
255 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  39.11 
 
 
253 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
273 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  34.54 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  35.54 
 
 
253 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>