More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2763 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  100 
 
 
251 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  89.64 
 
 
251 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  89.2 
 
 
254 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  83.67 
 
 
251 aa  430  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  82.87 
 
 
251 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  84.4 
 
 
273 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  83.6 
 
 
273 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  82.47 
 
 
251 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  83.6 
 
 
273 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  83.2 
 
 
281 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  83.2 
 
 
281 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  83.6 
 
 
273 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  70.8 
 
 
262 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  74.3 
 
 
273 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  70.28 
 
 
262 aa  353  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  70.28 
 
 
262 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  67.33 
 
 
256 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  72.69 
 
 
273 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  67.6 
 
 
251 aa  347  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  69.2 
 
 
262 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  69.44 
 
 
251 aa  345  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  67.73 
 
 
251 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  66.8 
 
 
259 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  66.93 
 
 
251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  71.2 
 
 
271 aa  338  4e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  69.6 
 
 
254 aa  324  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4455  ABC-2 type transporter  68.92 
 
 
251 aa  320  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0350682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  67.2 
 
 
251 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3395  hypothetical protein  67.6 
 
 
250 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  68.53 
 
 
251 aa  318  7e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0723  ABC-2 type transporter  68.53 
 
 
251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0756  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 
251 aa  310  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.97763  normal  0.423446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2942  hypothetical protein  65.6 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236721  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1893  ABC-2 type transport system permease protein  66.14 
 
 
251 aa  291  8e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 
268 aa  289  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  59.76 
 
 
268 aa  289  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  53.41 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  46.37 
 
 
270 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  44.35 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1229  ABC-2 type transporter  48.02 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  0.0330448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0401  ABC-2 type transporter  47.98 
 
 
302 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  43.32 
 
 
264 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0486  ABC-2 type transporter  43.95 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197916  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2479  hypothetical protein  42.47 
 
 
292 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2042  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 
273 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0166481 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.55 
 
 
254 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  40.49 
 
 
256 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 
253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  38 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  43.25 
 
 
253 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 
256 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 
256 aa  178  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
256 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
256 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
256 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4581  ABC-2 type transporter  44.8 
 
 
277 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
256 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 
256 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 
253 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  39.68 
 
 
256 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  37.75 
 
 
256 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 
254 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
256 aa  175  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  36 
 
 
256 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 
260 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1095  hypothetical protein  42.06 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 
256 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 
262 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 
253 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 
253 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  39.43 
 
 
263 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 
256 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 
253 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  35.25 
 
 
253 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  38.65 
 
 
258 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  38.65 
 
 
256 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  36.95 
 
 
257 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  35.77 
 
 
256 aa  169  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
256 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 
256 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  36.95 
 
 
256 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  37.1 
 
 
257 aa  168  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 
271 aa  168  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  35.92 
 
 
253 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  34.84 
 
 
253 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>