More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5992 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  477  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  70.31 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  73.91 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  63.04 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  60.87 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  67.19 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  60 
 
 		 261 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  59.46 
 
 		 269 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  54.98 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 		 304 aa  207  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  47.95 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.13 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  53.82 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  48.44 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  49.8 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  47.04 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  48.36 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  45.49 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  43.02 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.98 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  51.24 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.81 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.84 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.88 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.02 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  48.21 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  48.21 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  44.49 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.83 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  50.63 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  56.35 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 360 aa  92  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  32.21 
 
 		 356 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.81 
 
 		 339 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  32.01 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 360 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  28.09 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.56 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.05 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.02 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.73 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  31.09 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.45 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.84 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.16 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.04 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.63 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.55 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  33 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.98 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  33.53 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.66 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.79 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.01 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  24.17 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25.63 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  22.98 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>