108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 268 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  65.25 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  52.19 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  46.42 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  51 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  49.21 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  46.18 
 
 		 261 aa  178  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.83 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  49.41 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  48.88 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  43.33 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.21 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  46.9 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.9 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.51 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.45 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  48.61 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.04 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.93 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  40.34 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  44.69 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  45.42 
 
 		 263 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  43.35 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.66 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.92 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  47.88 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  44.16 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  42.63 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  39.42 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  25.44 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.58 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  25.44 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  25.44 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  25 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  25 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.9 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.1 
 
 		 356 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.9 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.29 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29.86 
 
 		 246 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0653  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4202  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  26.21 
 
 		 265 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  34.8 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.52 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  34.15 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.22 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  26.9 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.89 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2608  ABC-2 type transporter  39.34 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000624625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.96 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>