170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2343 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 304 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  62.9 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  55.24 
 
 		 252 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  56.4 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  60.47 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  68.72 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  52.42 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  52.38 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  49.23 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  51.82 
 
 		 269 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.8 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  49.41 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  54.13 
 
 		 245 aa  185  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  50.4 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  48.21 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  52.82 
 
 		 263 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  45.38 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  49.21 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  51.35 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.09 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  54.77 
 
 		 258 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  57.2 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  43.1 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  45.37 
 
 		 274 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  43.33 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  44.31 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  44.31 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.9 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.9 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.72 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.14 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  31.5 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.82 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.26 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  35.1 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.9 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.02 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.16 
 
 		 250 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.36 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.45 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 371 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  30.96 
 
 		 300 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 375 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  30.24 
 
 		 244 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29.25 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 367 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 251 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.56 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.85 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>