225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  62.26 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  60.87 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  53.67 
 
 		 261 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  52.34 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  54.94 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  54.15 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  52.14 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  44.76 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  43.57 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.08 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  43.8 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.37 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  45.7 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  43.17 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.25 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  42.02 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  45.04 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  39.69 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.55 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.93 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  39.3 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  39.3 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  39.92 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.81 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  39.51 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  40.98 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  48.89 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 366 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.3 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.2 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.52 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.73 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.31 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 363 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.63 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  23.08 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.14 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.96 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.79 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.7 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1028  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.48 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.19 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  24.07 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  22.82 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  22.82 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.67 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  23.65 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0505  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000955112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  23.79 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  24.69 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.73 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.73 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  24.9 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.97 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  26.27 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>