103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0192 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 244 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  43.62 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  42.32 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  45.56 
 
 		 269 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  40.83 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  43.62 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  39.51 
 
 		 275 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  41.91 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.34 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  40.76 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  41.46 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  37.82 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  39 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.42 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 269 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.16 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.69 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  38.27 
 
 		 274 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  39.24 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.66 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  38.05 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.32 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  32.94 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.94 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.45 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  32.16 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  34.89 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  22 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  22 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 		 360 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  28.85 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  21 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  21 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  21.5 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  21 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  21 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  21.5 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 360 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  21 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  20.5 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 290 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  19.49 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  32.61 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  31.33 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  31.46 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.52 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  32.53 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.73 
 
 		 356 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  33.92 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 285 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  26.67 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  30.54 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  22.75 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  32.61 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.73 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0193  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  31.52 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 298 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  29.35 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 256 aa  42  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 344 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 		 267 aa  42  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.77 
 
 		 267 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 278 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>