More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1211 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 252 aa  497  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  55.9 
 
 		 188 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  32.73 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  32.03 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.15 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  33.83 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.39 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.95 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  27.4 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.4 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  33.73 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0800  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0251444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  28.68 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  28.03 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  28.31 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  28.84 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  28.32 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  25.22 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  28.31 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  28.03 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  28.84 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.64 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  26.73 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  28.3 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  28.3 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  26.56 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.03 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  25.68 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  26.95 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  26.1 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  26.1 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  29.38 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.35 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  27.83 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  26.01 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  28.98 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  27.57 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  27.65 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.16 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  28.04 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  26.36 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.79 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  28.39 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  25.56 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>