More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0558 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  60.91 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  45.42 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  46.72 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  38.14 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  39.24 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  39.19 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.97 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  36.21 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  28.93 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  29 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 259 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  30.21 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  29.86 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  29.69 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  29.06 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  31.98 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  30.29 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  30.29 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  30.21 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  29.37 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.42 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  29.79 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  30.32 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  33.01 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  26.5 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  23.5 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.35 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  33.97 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  31.68 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  31.22 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.58 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.91 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  34.38 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.79 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  35.59 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  28.57 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.4 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.38 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  26.29 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  32.72 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  35.59 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>