More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0390 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  94.51 
 
 		 255 aa  487  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  95.29 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  43.82 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  41.27 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  36.89 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  38.28 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  39.2 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  35.04 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  43.06 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  37.14 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.73 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  38.65 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.98 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  39.37 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  36.61 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  36.44 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  43.41 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.52 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  35.8 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  38.84 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  39.27 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.27 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  38.46 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  37.55 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  35.18 
 
 		 269 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.18 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  35.57 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.73 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  37.05 
 
 		 285 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  35.51 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.18 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  35.18 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.87 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  35.51 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  35.25 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  34.68 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.92 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  35.25 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.34 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.18 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  38.16 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  34.02 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  38.18 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  32.1 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  33.2 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  33.2 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  33.2 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  34.35 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.94 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.18 
 
 		 622 aa  112  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  36.79 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.7 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.78 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.12 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  29.34 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  30.61 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.2 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.4 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.17 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>