More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3795 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  100 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  55.97 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  44.49 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 
263 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 
261 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  42.52 
 
 
262 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  38.31 
 
 
256 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  36.08 
 
 
258 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 
262 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  36.14 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 
261 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  35.74 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  38.49 
 
 
263 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 
255 aa  161  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  41.46 
 
 
254 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  38.06 
 
 
285 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  38.43 
 
 
282 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
270 aa  158  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  37.84 
 
 
255 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  37.84 
 
 
255 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  41.51 
 
 
267 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  42.52 
 
 
289 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  35.4 
 
 
262 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  36.44 
 
 
275 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.06 
 
 
258 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  39.06 
 
 
258 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  39.72 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  31.66 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  37.65 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.02 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.45 
 
 
263 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  39.72 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  37.65 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  39.25 
 
 
278 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  39.53 
 
 
279 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.38 
 
 
273 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  40.38 
 
 
273 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  39.25 
 
 
277 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  34.6 
 
 
273 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  40.47 
 
 
277 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  40.47 
 
 
277 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  33.06 
 
 
268 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  38.79 
 
 
275 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  34.93 
 
 
280 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
276 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  35.29 
 
 
271 aa  141  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.71 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30.77 
 
 
262 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  39.39 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  39.07 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  39.07 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  39.07 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.77 
 
 
262 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  35.16 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.09 
 
 
269 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  34.09 
 
 
269 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 
268 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
269 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.89 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  31.66 
 
 
278 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 
278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.81 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.62 
 
 
622 aa  118  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.02 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  32.87 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 
269 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
265 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
271 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
269 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
266 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.53 
 
 
304 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
285 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
294 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  28.24 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  25.21 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  26.84 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 
253 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  24.89 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  23.9 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  23.87 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>