198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3799 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 266 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  90.6 
 
 		 271 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  45.16 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  43.72 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 		 253 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  39.33 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 		 294 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  41.67 
 
 		 622 aa  142  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.36 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.68 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.77 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  35.77 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  31.95 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  32.35 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  33.89 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  35.83 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  33.99 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.96 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.48 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  32.51 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.47 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.78 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  34.98 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  34.98 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.38 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31.38 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.89 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  30 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  35.29 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  33.82 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  34.8 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  34.8 
 
 		 277 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.32 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  29.24 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  34.92 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  32.16 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  32.51 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  36.17 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.44 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  35.09 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.3 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  30.94 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  27.31 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  31.05 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.35 
 
 		 253 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  32.54 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  30.73 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.07 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.92 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  28.92 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  27.73 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  28.2 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  27.94 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  30.36 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.03 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  27.24 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.48 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.62 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.11 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.11 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.32 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>