More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1206 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 243 aa  480  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  60.91 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  46.9 
 
 		 244 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  41.35 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  38.63 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 244 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  35.24 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  39.48 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  35.27 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  35.48 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  29.72 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  32.37 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  31.4 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  30.33 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  32.37 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  34.15 
 
 		 277 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 259 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  31.96 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  30.43 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  25.21 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  29.95 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.34 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 281 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  27.78 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.93 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  33.05 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  32.11 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  28.57 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  28.57 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.77 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3273  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, inner membrane subunit  32.24 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4006  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  26.86 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  28.99 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  32.21 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  29.13 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  33.15 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  29.22 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  31.07 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  31.72 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.91 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  29.57 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  25.41 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  32.87 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.49 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2013  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2287  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.06 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  28.71 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  28.71 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  34.08 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  29.57 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  27.16 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  30.08 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  32.4 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>