More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0988 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 260 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  57.53 
 
 		 261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  59.29 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  55.51 
 
 		 263 aa  291  6e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  52.78 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  48.05 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  43.43 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  38.58 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  38.58 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  37.14 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  38.84 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  38.08 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.9 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  37.35 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  36.48 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  35.55 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  35.69 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  34.63 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  39.44 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.89 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.96 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  35.94 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  37.18 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  35.74 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  35.66 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  34.82 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  37.22 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  35.16 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  35.16 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.55 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  32.16 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  33.2 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  32.55 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  36.19 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  33.2 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  35.47 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  33.59 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  33.59 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  37.67 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  31.94 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  31.76 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  37.16 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.4 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.13 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  33.6 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  33.2 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.98 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  30.63 
 
 		 622 aa  107  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.55 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  30.98 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  35.44 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.79 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  35.44 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  32.43 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  32.28 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  36.04 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  31.58 
 
 		 256 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.19 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  31.18 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  25.61 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0280  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>