188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1764 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1764  ABC transporter protein  100 
 
 		 272 aa  531  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3798  ABC-2 type transporter  56.75 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3421  ABC-2 type transporter  55.16 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  48.7 
 
 		 276 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1802  ABC-2 type transporter  49.61 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.351886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  45.63 
 
 		 269 aa  214  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04720  ABC-2 type transporter, NodJ family  45.78 
 
 		 622 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.161993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.13 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1119  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1193  ABC-2 type transporter  43.09 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1175  ABC-2 type transporter  45.71 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12470  ABC-2 type transporter  46.24 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.972225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  36.69 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  36.61 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4127  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.492471  hitchhiker  0.00784799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0745  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.150694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  31.87 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  31.48 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  35.57 
 
 		 255 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1483  ABC transporter, permease NodJ  36.11 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1174  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4650  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1803  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  31.94 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1116  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.517895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  28.69 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.69 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  30 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  29.58 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2517  hypothetical protein  35.08 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0932407  normal  0.411033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  30.62 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.85 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1865  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.424245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1118  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1143  ABC transporter  29.92 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0988  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.162248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.19 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  31.76 
 
 		 268 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25210  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.43 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  29.39 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1938  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.92 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  32.02 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1192  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  30.13 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  30.98 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3795  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4030  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.12 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  29.21 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3422  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1093  ABC transporter  30.97 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.367707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2120  ABC-2 type transporter, NodJ family  34.7 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  28.63 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  30.74 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  29.5 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  27.69 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3799  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103899 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.12 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5040  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.48 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  29.06 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  27.31 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3235  ABC-2 type transporter, permease protein, NodJ family  33.76 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2836  ABC-2 type transporter, NodJ family  33.76 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  30.98 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  29.62 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  29.8 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  29.23 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  29.23 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  29.23 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  28.85 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.31 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.31 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1765  ABC transporter protein  34.48 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4920  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.03 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  28.5 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  27.69 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  27.69 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  27.32 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  25.4 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.63 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.18 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  24.55 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>