More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1307 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 271 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  64.94 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  37.61 
 
 		 244 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 243 aa  99.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  32.18 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  27.43 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.17 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.66 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.34 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.16 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  28.64 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1801  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2287  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  28.64 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  27.16 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.33 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.37 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  27.8 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  27.23 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.48 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  29.21 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  27.7 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  27.4 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  29.31 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  27.7 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  27.7 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  28.1 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  27.7 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  27.7 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  27.72 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.13 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2013  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  29.27 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3121  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  25.64 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  28.99 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  28.02 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  28.29 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  28.78 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  27.36 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.98 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>