More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0687 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  543  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  64.94 
 
 		 271 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  38.63 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  40.53 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  33.74 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  36.98 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 251 aa  89  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.54 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  31.19 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  31.22 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2018  hypothetical protein  31.19 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.803499  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  29.32 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  29.8 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  30.39 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  32.49 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0616  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.33089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  28.43 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  29.21 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  29.21 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2287  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3371  hypothetical protein  30.96 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  31.16 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  27.51 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  31.19 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  27.92 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  26.46 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  26.73 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.39 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1926  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.14437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  30.2 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  27.23 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  31.43 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  26.29 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  27.15 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  27.6 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  29.11 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1658  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1453  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  28.43 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  25.4 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  27.51 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  27.65 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  27.05 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0746  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0827926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>