More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1212 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 259 aa  510  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  37.86 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  34.3 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.31 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  28.51 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  31.07 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0482  ABC-2 type transporter, NodJ family  31.28 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.634279  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3712  ABC transporter  31.28 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3557  ABC transporter  31.06 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0239  ABC transporter  30.24 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  30.04 
 
 		 277 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  30 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0632  ABC transporter  30.71 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1642  ABC transporter  29.17 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3574  ABC transporter  32.2 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4733  ABC efflux pump, inner membrane subunit, NodJ  29.61 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  27.5 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  27.5 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  29.41 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.39 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  28.22 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  28.22 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  29.81 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  27.51 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.86 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  26.77 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4965  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.82 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4260  ABC transporter  29.49 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0875  hypothetical protein  26.36 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.699807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7719  ABC transporter  28.99 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  26.77 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  24.89 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  29.37 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  26.51 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  29.41 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.94 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  28.16 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6188  ABC transporter  29.63 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  29.37 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.92 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.92 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  29.69 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2129  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.11 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0390  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.76 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  29.53 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1805  ABC-2 type transporter, NodJ family  29.38 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  30.62 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  29.3 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  29.66 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3828  ABC transporter  25.81 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  24.24 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0658  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.558241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  27.92 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  27.59 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>