More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1637 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1637  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 188 aa  362  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  51.37 
 
 		 252 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0552  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 244 aa  89.4  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0558  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1212  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.962792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  32.1 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1171  16S rRNA processing protein RimM  28.97 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.730617  hitchhiker  0.000000152208 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  29.45 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.41 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0574  ABC-2 type transporter permease protein  31.72 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1984  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0219123  normal  0.0104118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  28.57 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15510  ABC-2 type transporter, permease component  28.67 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  28.67 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  26.39 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  32.65 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  30.56 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  27.4 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  28.77 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0977  ABC transporter permease protein  31.03 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.024266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4180  hypothetical protein  28.08 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  29.45 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  27.4 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1920  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00135758  normal  0.376856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  27.47 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  27.47 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  29.45 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3928  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  29.45 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  29.45 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  29.45 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  25.13 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1779  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4165  ABC-2 type transporter, NodJ  29.94 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.343594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3819  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.728867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  26.39 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3284  hypothetical protein  28.37 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0995545  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  26.53 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1506  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  29.86 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  26.9 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  27.66 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.03 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  27.71 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  25.83 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  27.66 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  28.47 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.45 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  28.87 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>