More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0987 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  100 
 
 
247 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  56.97 
 
 
245 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  54.58 
 
 
245 aa  265  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  27.66 
 
 
256 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
259 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 
249 aa  108  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  32.24 
 
 
255 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  30.84 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.1 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.91 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.79 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.33 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1211  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0723  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  24.68 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3519  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.238751  normal  0.0167423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3816  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3588  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0782802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3711  ABC-2 type transporter  24.46 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0690  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809524  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25.82 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  25.11 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.39 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0652  hypothetical protein  24.15 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3140  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.432553  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  25.42 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0831  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
372 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3801  ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  28.57 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.92 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0559  ABC transporter permease protein  24.59 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0495  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
370 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  25.11 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0795  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0454  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0430  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.02 
 
 
376 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  25 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3143  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0824  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  20 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.77 
 
 
253 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  22.98 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.75 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.45 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3908  ABC-2 type transporter  23.83 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.07 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0687  hypothetical protein  29.67 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 
281 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  29.01 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
360 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3231  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
243 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.48 
 
 
369 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  25.82 
 
 
369 aa  58.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 
288 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  23.5 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  20.42 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2111  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218796  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
285 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 
360 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1078  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 
260 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  23.46 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
366 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  25.21 
 
 
254 aa  55.5  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
339 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>