More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5571 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  61.76 
 
 		 245 aa  272  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  59.66 
 
 		 243 aa  250  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  56.38 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  56.6 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  56.07 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  53.08 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  53.47 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.33 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  51.68 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  53.88 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.78 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  45.81 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.22 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  46.22 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  50.68 
 
 		 522 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  37.97 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  61.64 
 
 		 160 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  38.66 
 
 		 341 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  35.17 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  38.51 
 
 		 339 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  38.51 
 
 		 339 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  38.12 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  37.89 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 376 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.17 
 
 		 377 aa  115  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 		 339 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  37.27 
 
 		 339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  34.16 
 
 		 337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  37.27 
 
 		 339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  37.32 
 
 		 365 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  31.98 
 
 		 380 aa  99.8  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 347 aa  97.8  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 338 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  30.82 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.11 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.68 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 367 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.28 
 
 		 365 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.93 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.37 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  30 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  28.3 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  29.41 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  25.24 
 
 		 373 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 373 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  30 
 
 		 379 aa  62  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  27.4 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.86 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  30.08 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  27.8 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 374 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.32 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  27.33 
 
 		 352 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  28.5 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  28.09 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  28.5 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  27.44 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>