More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 243 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  59.66 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  54.69 
 
 		 245 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  52.07 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  52.65 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  47.56 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  52.32 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  51.93 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  53.03 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  49.15 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  51.5 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  47.16 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.33 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  38.02 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  50.48 
 
 		 522 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.78 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  45.78 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  55.28 
 
 		 160 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  35.44 
 
 		 339 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 339 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  34.95 
 
 		 339 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  34.95 
 
 		 339 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  34.16 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  34.47 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  34.47 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 		 376 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  33.13 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 341 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  36.65 
 
 		 337 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  30.35 
 
 		 380 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  35.83 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  35.9 
 
 		 347 aa  98.6  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.85 
 
 		 377 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  32.49 
 
 		 338 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.54 
 
 		 369 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  30.73 
 
 		 366 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  33.75 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 376 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  29.69 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.63 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.88 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.55 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.3 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.63 
 
 		 379 aa  75.5  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.5 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.84 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  27.41 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  28.33 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  29.14 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.26 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 373 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 373 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 373 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 378 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  35.07 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  30.2 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  31.67 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  33.57 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  29.21 
 
 		 922 aa  68.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.67 
 
 		 380 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  28.83 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 371 aa  67  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  27.53 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 375 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  30.41 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>