284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4462 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  65.08 
 
 		 247 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  54.37 
 
 		 245 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  61.64 
 
 		 240 aa  157  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  53.75 
 
 		 251 aa  148  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  50.94 
 
 		 226 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  59.12 
 
 		 251 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  57.86 
 
 		 251 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  50.32 
 
 		 226 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  55.28 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  57.14 
 
 		 252 aa  137  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  50.96 
 
 		 226 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  50.96 
 
 		 226 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  51.57 
 
 		 241 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  49.06 
 
 		 289 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  48.12 
 
 		 522 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 		 241 aa  97.1  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  32.91 
 
 		 260 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  48.47 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 		 241 aa  94.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  33.76 
 
 		 341 aa  94  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  32.14 
 
 		 339 aa  90.5  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  32.14 
 
 		 339 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  32.14 
 
 		 339 aa  90.5  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  32.14 
 
 		 339 aa  90.5  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 339 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  34.96 
 
 		 339 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 		 339 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 339 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 		 339 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  31.4 
 
 		 365 aa  87.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 376 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.03 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 337 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  32.5 
 
 		 380 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 		 338 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 377 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 386 aa  67.8  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 347 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  28.33 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  40.18 
 
 		 376 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  41.96 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  32.17 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 380 aa  60.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  38.39 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  35.65 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  28.22 
 
 		 376 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.43 
 
 		 249 aa  57.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  26.11 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.57 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.02 
 
 		 385 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  29.46 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.68 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  34.78 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  29.66 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 376 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  30.36 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30.09 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 371 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 376 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 384 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 371 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 366 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 381 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 339 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  30.43 
 
 		 378 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 370 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.43 
 
 		 380 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 369 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  32.28 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  28.15 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  30 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 245 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.61 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.78 
 
 		 365 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  27.81 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  27.81 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  27.81 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>