More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1853 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 386 aa  766    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  39.91 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3741  ABC-2 type transporter  40.69 
 
 		 523 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1509  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.377329  normal  0.352445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0059  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.42 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.17 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.83 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  24.65 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  24.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  24.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  24.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  24.65 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  27 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.08 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  27.82 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 370 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  23.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.3 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.22 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  34.97 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  34.97 
 
 		 339 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.56 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 339 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  34.27 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  34.27 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  24.65 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 		 339 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.77 
 
 		 373 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.54 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  26.54 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 378 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  33.57 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  26.93 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.93 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 369 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  20.9 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 381 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  25.91 
 
 		 260 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  25.57 
 
 		 241 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.9 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 241 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 375 aa  92.8  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  25.28 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  34.27 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  22.74 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.65 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  24.81 
 
 		 917 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.97 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  23.86 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.65 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  25.41 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23.5 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>