More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0059 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0059  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 492 aa  942    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 		 386 aa  156  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3741  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 523 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1509  ABC-2 type transporter  29 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.377329  normal  0.352445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 367 aa  94.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 371 aa  93.6  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.06 
 
 		 376 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  30.22 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 384 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.23 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  34.44 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  30.68 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  32.74 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.94 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  34.16 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  28.88 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 376 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  31.01 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.23 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.06 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  28.18 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.43 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.21 
 
 		 382 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.13 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  26.37 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.23 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  27.91 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  30.64 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  30.12 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  31.38 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  33.74 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 378 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.32 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  26.49 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  31.4 
 
 		 1106 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  24.12 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  26.49 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  26.5 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  26.5 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  26.5 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  26.5 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 341 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  28.64 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  26.5 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  26.67 
 
 		 691 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  31.74 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  29.28 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.62 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  26.37 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>