More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1509 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1509  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 501 aa  984    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.377329  normal  0.352445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3741  ABC-2 type transporter  82.44 
 
 		 523 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  37.98 
 
 		 508 aa  289  8e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 		 386 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0059  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 376 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.14 
 
 		 376 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  30.77 
 
 		 382 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  31.74 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  34.81 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  34.76 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 369 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.06 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  28.4 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.52 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  31.45 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.65 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  30.43 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.22 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  28.34 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  29.79 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.61 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  29.44 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  32.89 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  30.08 
 
 		 930 aa  70.5  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  30.82 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 366 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  26.67 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  26.67 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  33.13 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  31.25 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.37 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.77 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  30.72 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  30.67 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  31.64 
 
 		 943 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 370 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  33.56 
 
 		 906 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  36.64 
 
 		 376 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  30.46 
 
 		 383 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  29.09 
 
 		 366 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  30.95 
 
 		 917 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.67 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  27.42 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>