More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3101 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 344 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  46.82 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  40.19 
 
 		 251 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  40.19 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 		 339 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 250 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  40.29 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 367 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.78 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.23 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 247 aa  89.7  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.61 
 
 		 365 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.98 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.44 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.14 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  29.32 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  22.93 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  33.33 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  29.28 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 257 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.81 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.43 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.82 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  21.47 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28.71 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  21.47 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  21.54 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  29.09 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  27.88 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  24.43 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1509  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.377329  normal  0.352445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  21.04 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  21.04 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.52 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  21.04 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.5 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  29.59 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  30.89 
 
 		 261 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  20.73 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3741  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  26.35 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  25.57 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  21.72 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  26.35 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  25.57 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  25.57 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  26.35 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  30.32 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  29.72 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  20.86 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.13 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  28.21 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.87 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>