More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1758 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 341 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  50.87 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  50.58 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  51.61 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  50.29 
 
 		 339 aa  335  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  50 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  50 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  49.71 
 
 		 339 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  52.02 
 
 		 339 aa  325  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  51.16 
 
 		 339 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  51.91 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  45.77 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  36.51 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  34.69 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.22 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  31.4 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  43 
 
 		 241 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  42.5 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  42 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  40.11 
 
 		 240 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  32.39 
 
 		 245 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.67 
 
 		 251 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  38.07 
 
 		 252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  36.63 
 
 		 226 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.08 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.5 
 
 		 243 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  27.4 
 
 		 369 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.07 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  35.35 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.16 
 
 		 226 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.16 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  40.36 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  43.12 
 
 		 240 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.65 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 		 247 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  34.16 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.16 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.56 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.02 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 289 aa  99.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.27 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.27 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.6 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 245 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 384 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.6 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  25.53 
 
 		 374 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 		 384 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 369 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.89 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  26.59 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.27 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.69 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 378 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  22.4 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 376 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.4 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.29 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  24.54 
 
 		 377 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.78 
 
 		 373 aa  86.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.62 
 
 		 366 aa  86.3  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.55 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.31 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  33.76 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.47 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  22.73 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.73 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  21.14 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  24.57 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  24.26 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  24.04 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>