More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SEA0017 on replicon NC_006663
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 376 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.6 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  40.74 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  36.68 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  37.03 
 
 		 339 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  37.03 
 
 		 339 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  36.41 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  34.65 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  35.99 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  34.42 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 260 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  43.68 
 
 		 241 aa  162  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  39.5 
 
 		 241 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  32.61 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.96 
 
 		 243 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  34.85 
 
 		 226 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 353 aa  116  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.62 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40 
 
 		 251 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.14 
 
 		 381 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  38.24 
 
 		 240 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  37.01 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.01 
 
 		 226 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  35.71 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  33.51 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 		 380 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.58 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.93 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  26.55 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.93 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  25.6 
 
 		 369 aa  95.9  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  25.61 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 245 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.45 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  25.34 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  25.46 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  36.71 
 
 		 522 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.57 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 245 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.48 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  20.84 
 
 		 906 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 370 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  34.97 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  20.58 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  20.32 
 
 		 906 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  30.81 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.22 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  21.83 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  21.9 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  23.42 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  23.75 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  21.55 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  21.12 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  20.1 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.34 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.16 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>