More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2973 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  99.56 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  99.56 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  80.09 
 
 		 251 aa  342  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  76.44 
 
 		 226 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  58.67 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  58.08 
 
 		 252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  61.32 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  52.21 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  47.35 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  48.89 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  45.78 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.33 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  40.44 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  47.12 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  48.26 
 
 		 522 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4462  hypothetical protein  50.32 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  36.32 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  35.79 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 		 341 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  31.41 
 
 		 339 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  37.32 
 
 		 365 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  29.84 
 
 		 339 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  30.37 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  30.37 
 
 		 339 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  37.01 
 
 		 376 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 		 339 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  29.84 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  29.84 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  33.83 
 
 		 380 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 		 347 aa  96.7  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  32.74 
 
 		 337 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.43 
 
 		 377 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.96 
 
 		 379 aa  85.1  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  27.06 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.72 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 376 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  25.67 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  26.2 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  25.13 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 367 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  27.54 
 
 		 378 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 381 aa  72  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.89 
 
 		 365 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.66 
 
 		 371 aa  71.6  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 388 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.36 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  26.95 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0697  hypothetical protein  25.84 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 384 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  34.03 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0715  hypothetical protein  25.84 
 
 		 373 aa  68.6  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 372 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.27 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.4 
 
 		 373 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.71 
 
 		 382 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 380 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  27.89 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 373 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  30.72 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  29.45 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  27.89 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  29.05 
 
 		 376 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>