More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2352 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  100 
 
 
339 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  92.04 
 
 
339 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  91.45 
 
 
339 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  93.22 
 
 
339 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  91.15 
 
 
339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  91.74 
 
 
339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  91.15 
 
 
339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  91.15 
 
 
339 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  94.1 
 
 
339 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  92.04 
 
 
337 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  52.02 
 
 
341 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  43.44 
 
 
338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  36.71 
 
 
365 aa  229  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 
376 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.51 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  32.11 
 
 
380 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
241 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  42.79 
 
 
260 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  42 
 
 
241 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
347 aa  155  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 
245 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  36.11 
 
 
252 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  38.51 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  38.42 
 
 
251 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.25 
 
 
251 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.16 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.92 
 
 
381 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  41.32 
 
 
240 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.15 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  35.6 
 
 
226 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.35 
 
 
384 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.82 
 
 
376 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  38.27 
 
 
522 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
384 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
241 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.41 
 
 
226 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 
388 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
353 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 
245 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  32.75 
 
 
226 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.75 
 
 
226 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 
367 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.61 
 
 
251 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.36 
 
 
384 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
387 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 
247 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  29.02 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.53 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  32.91 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.72 
 
 
380 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  25.21 
 
 
375 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 
380 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.98 
 
 
360 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
245 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
370 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
371 aa  92.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.12 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.36 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 
381 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.32 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
371 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  24.93 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 
245 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 
372 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
375 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.91 
 
 
373 aa  87  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 
360 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  26.01 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.91 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.41 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  24.93 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.52 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.99 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  24.26 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
378 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  23.1 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.3 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  25.68 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>