More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0259 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  100 
 
 
365 aa  724    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.15 
 
 
377 aa  260  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  37.43 
 
 
339 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 
339 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 
376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  36.61 
 
 
339 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  36.44 
 
 
339 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
339 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  38.26 
 
 
380 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  36.34 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  36.34 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2352  ABC-2 type transporter  36.71 
 
 
339 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.229577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 
341 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
339 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2281  ABC transporter, permease  36.44 
 
 
337 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 
338 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
241 aa  151  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  39.27 
 
 
260 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  40.88 
 
 
241 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3178  multidrug ABC transporter inner membrane protein  38.86 
 
 
251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.458252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3403  multidrug ABC transporter inner membrane protein  39.43 
 
 
251 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2643  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  32.39 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 
347 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  26.33 
 
 
384 aa  123  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.61 
 
 
381 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.74 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5571  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 
240 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00648583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  33.53 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.96 
 
 
243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11702  ABC-2 type transport system permease protein  36.94 
 
 
226 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.342622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.61 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  30.39 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.83 
 
 
380 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.15 
 
 
374 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  25.91 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  27.11 
 
 
378 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 
384 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  25.13 
 
 
376 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2973  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.2 
 
 
226 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 
384 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 
245 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2958  ABC transporter, DrrB efflux protein  35.22 
 
 
226 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0438  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 
245 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3002  multidrug ABC transporter inner membrane protein  35.22 
 
 
226 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.377111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 
353 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3297  multidrug ABC transporter inner membrane protein  36.31 
 
 
251 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3633  ABC-2 type transporter  31.96 
 
 
241 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 
387 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.8 
 
 
376 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 
373 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 
386 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0577  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 
247 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 
367 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 
378 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 
371 aa  99.4  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2579  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 
245 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4952  ABC transporter related  36.6 
 
 
522 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221513  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3129  ABC-2 transporter component  24.28 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0000316988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.06 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.05 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
373 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
373 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
369 aa  95.9  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1368  ABC-2 type transporter  33.53 
 
 
289 aa  95.9  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.20656  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0418  ABC-2 type transporter  35.33 
 
 
240 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.49 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.87 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.24 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 
373 aa  93.2  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.09 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 
370 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 
377 aa  92.8  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.82 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.89 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  21.01 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6564  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  24.8 
 
 
369 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.32 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  21.96 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.75 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
370 aa  89.7  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  21.73 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.68 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.47 
 
 
380 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
339 aa  87  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 
390 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>