133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1062 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 367 aa  755    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  51.75 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  50.54 
 
 		 369 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  51.35 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  51.21 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  49.73 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  51.48 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  50.67 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  50.67 
 
 		 369 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  50.67 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  49.71 
 
 		 346 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2624  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  23.85 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0077  ABC-2 type transporter  19.87 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  21.25 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  25.14 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  18.93 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.94 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  19.52 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10720  hypothetical protein  22.48 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.43 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  20.58 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 241 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  19.13 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.26 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  19.05 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  19.05 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.61 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.71 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.04 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  20.26 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.04 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  19.93 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.18 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2950  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  23.97 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.404593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  22.78 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  19.27 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  24.88 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.46 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  24.4 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.9 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.31 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  21.98 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  24.68 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  21.36 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.55 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.13 
 
 		 431 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  24.68 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  21.59 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1308  hypothetical protein  22.12 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  22.7 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.74 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.42 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.02 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  18.36 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  25.93 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  20.92 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  20.92 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  20.92 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  20.92 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  20.92 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  20.42 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  19.49 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  22.46 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  20.11 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  21.02 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  21.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.11 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  19.23 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  21.7 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>