170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4702 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 397 aa  771    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.43 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.73 
 
 		 382 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.44 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  25.65 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  25.21 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.66 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  22.53 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  26.69 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  24.07 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  27.1 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.97 
 
 		 907 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  27.09 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  25 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  27.1 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  20.23 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  20.92 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  20.4 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  23.22 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.58 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  24.51 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1842  ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.737626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  27.63 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  25.81 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1421  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  25.16 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  24.37 
 
 		 906 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  25.16 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 		 360 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  24.32 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  24.87 
 
 		 906 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  24.26 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  23 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  20.11 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  19.6 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  19.06 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.81 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  24.68 
 
 		 906 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1739  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.68 
 
 		 906 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  18.82 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  22.64 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  23.24 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  21.51 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  21.77 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  18.82 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.96 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  19.71 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.6 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2422  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  21.98 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  19.71 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  19.71 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  21.24 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>