237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29670 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 396 aa  762    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.62 
 
 		 431 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.98 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  29.53 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 360 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  25.63 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.6 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  25.84 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.79 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  24.01 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.19 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  21.26 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  20.72 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.15 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  21.5 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  21.72 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.31 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  24.93 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  24.45 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.59 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.99 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  22.32 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  19.32 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  22.32 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.86 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  22.32 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  22.32 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.24 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  22.32 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  20.59 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  21.74 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 372 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  24.49 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  24.38 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  19.37 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  25.41 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 376 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  28.24 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  21.41 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  25.13 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  24.4 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  24.34 
 
 		 906 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0895  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  27.78 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>