123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3063 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
431 aa  878    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  38.57 
 
 
440 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
407 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
403 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  25.34 
 
 
449 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 
408 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  27.74 
 
 
395 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.62 
 
 
396 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
380 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
430 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  23.67 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  19.78 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  28.96 
 
 
398 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.09 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  25.06 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 
339 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  22.32 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  23.72 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  24.19 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  19.17 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.62 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.41 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 
367 aa  63.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  22.93 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  24.11 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 
369 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.87 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  22.17 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  22.17 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  22.17 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.24 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  21.33 
 
 
365 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  23.41 
 
 
381 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  21.03 
 
 
386 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  21.38 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.54 
 
 
371 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  24.34 
 
 
268 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  21.77 
 
 
365 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  20.96 
 
 
374 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3135  hypothetical protein  22.16 
 
 
393 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2823  hypothetical protein  21.98 
 
 
393 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
375 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 
381 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2892  hypothetical protein  20.79 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0559889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2132  phage infection protein  20.6 
 
 
393 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  22.2 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2866  hypothetical protein  21.43 
 
 
393 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.96349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.11 
 
 
369 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3105  phage infection protein  20.1 
 
 
393 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  21.93 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  19.52 
 
 
376 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  22.03 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2897  hypothetical protein  20.93 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3114  hypothetical protein  20.93 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  21.28 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  19.81 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  27.56 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  23.13 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  19.71 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  19.11 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.77 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
268 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  20.18 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3138  hypothetical protein  21.43 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.393136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3117  hypothetical protein  20.93 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  18.93 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  18.93 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  18.93 
 
 
373 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 
366 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  23.12 
 
 
915 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  21.63 
 
 
383 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  22.73 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.84 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  20 
 
 
254 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  20.7 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  19.85 
 
 
376 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 
374 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>