293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4114 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 437 aa  874    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.32 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.67 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  26.34 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 398 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.75 
 
 		 382 aa  86.7  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  25 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  31.94 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.38 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.08 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  23.31 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  28.57 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 268 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  21.97 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  32.59 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.78 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  30.49 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 		 269 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  31.29 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  31.94 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  23.35 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.77 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.48 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  20.76 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  24.55 
 
 		 915 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.97 
 
 		 261 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 268 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  27.46 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  27.4 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.8 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.33 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  28 
 
 		 901 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.4 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.07 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  26.55 
 
 		 920 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  25.33 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 285 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  20.93 
 
 		 372 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  23.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>