241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0131 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 418 aa  833    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  51.77 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  32.2 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  33.17 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  25.72 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  29.12 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  31.95 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.5 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.5 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  22.88 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.18 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.45 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  24.2 
 
 		 373 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  22.19 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.28 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  24.57 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.11 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  26.02 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  23.67 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.53 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  20.82 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  26.44 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25.61 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25.61 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  27.14 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25.61 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25.61 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  20.31 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  19.43 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.27 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  25.54 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  21.89 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  26.23 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  24.57 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  23.91 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  23.91 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.12 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.67 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  21.27 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 366 aa  55.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  23.37 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  26.23 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  25.93 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  23.37 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  25.92 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.58 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.52 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>