122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0386 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  100 
 
 		 428 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 		 425 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  35.84 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  28.22 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  24.59 
 
 		 383 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.23 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  21.87 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  22.38 
 
 		 922 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.33 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  22.01 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  30.43 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  21.56 
 
 		 906 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  31.69 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  23.87 
 
 		 911 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  22.75 
 
 		 943 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  24.09 
 
 		 915 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  22.89 
 
 		 929 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.88 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  22.65 
 
 		 932 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.28 
 
 		 907 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  22.64 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  21.33 
 
 		 906 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  21.92 
 
 		 926 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  22.09 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  29.89 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  23.65 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  23.65 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.33 
 
 		 906 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  23.65 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  23.65 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  23.87 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  21.86 
 
 		 914 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.38 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  23.65 
 
 		 911 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  23.65 
 
 		 911 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  21.56 
 
 		 930 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  19.4 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  23.42 
 
 		 911 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  20.67 
 
 		 901 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  20.65 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.27 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  20.41 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  29.51 
 
 		 911 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  19.71 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  21.7 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.69 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2899  hypothetical protein  24.31 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0941072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  22.14 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.47 
 
 		 365 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  22.2 
 
 		 901 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  22.61 
 
 		 914 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  20.09 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  26.11 
 
 		 919 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  20.85 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  22.17 
 
 		 913 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  21.35 
 
 		 913 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  21.77 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  25 
 
 		 922 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  20.26 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  21.71 
 
 		 913 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20.57 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  21.71 
 
 		 913 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  27.35 
 
 		 928 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  21.71 
 
 		 913 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  21.45 
 
 		 933 aa  46.6  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  20.87 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  21.04 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  19.72 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.07 
 
 		 916 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.03 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  21.04 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.58 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  28.25 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  23.33 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  21.72 
 
 		 930 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  22.5 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  19.85 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  22.54 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  16.88 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  24.44 
 
 		 927 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>