206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 382 aa  741    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  27.25 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.05 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.08 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.16 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  18.91 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  19.38 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  19.95 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  19.68 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  20.16 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  18.03 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  20.08 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.18 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.35 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  22.67 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  18.4 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.22 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.96 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.67 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  21.91 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  24.87 
 
 		 928 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  24.87 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  22.81 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  18.97 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  18.97 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  19.1 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  18.03 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.61 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  19.1 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  25.41 
 
 		 901 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  18.85 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  18.87 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  18.12 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  21.53 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  18.38 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  25.67 
 
 		 906 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  21.31 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 780 aa  56.6  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  20.05 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  21.01 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  21.61 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  22.91 
 
 		 906 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  20.76 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  20.54 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  25.48 
 
 		 915 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 		 241 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  23.92 
 
 		 906 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  21.96 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  21.22 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  19.2 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  21.88 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  25.13 
 
 		 906 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  19.89 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  21.27 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.83 
 
 		 391 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  24.35 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 375 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.07 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  19.37 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.8 
 
 		 384 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  20.86 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  21.74 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  24.94 
 
 		 912 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  20.55 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  23.86 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  20.89 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  20.49 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  28.34 
 
 		 942 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  21.17 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.48 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  24.48 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>