More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2702 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 780 aa  1533    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  32.31 
 
 		 405 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 367 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  34.59 
 
 		 383 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  35.88 
 
 		 402 aa  183  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 397 aa  183  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 392 aa  182  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  33.24 
 
 		 383 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  34.25 
 
 		 382 aa  181  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 395 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 		 378 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  33.06 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 383 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 496 aa  175  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 379 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 381 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 381 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  30.14 
 
 		 381 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  31.01 
 
 		 378 aa  171  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 382 aa  170  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 383 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  30.95 
 
 		 383 aa  168  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  30.88 
 
 		 383 aa  168  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 384 aa  165  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  30.79 
 
 		 386 aa  160  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  30.66 
 
 		 395 aa  160  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  33.23 
 
 		 377 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  32.77 
 
 		 375 aa  157  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  32.12 
 
 		 377 aa  157  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 377 aa  155  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  31.23 
 
 		 293 aa  154  5.9999999999999996e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 384 aa  151  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 382 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 381 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 395 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  26.19 
 
 		 383 aa  131  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.28 
 
 		 387 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.35 
 
 		 395 aa  128  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.07 
 
 		 362 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  26.51 
 
 		 379 aa  121  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  26.22 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  25.6 
 
 		 378 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  26.35 
 
 		 372 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 391 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  28.05 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 388 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  26.41 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  25.73 
 
 		 395 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  28.35 
 
 		 390 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  26.3 
 
 		 379 aa  98.6  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 387 aa  98.2  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 431 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.73 
 
 		 415 aa  97.4  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  26.27 
 
 		 376 aa  97.4  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 389 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.51 
 
 		 384 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 417 aa  95.1  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 384 aa  94.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25.71 
 
 		 435 aa  94  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.77 
 
 		 379 aa  94  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  24.23 
 
 		 434 aa  93.2  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  25.06 
 
 		 429 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 378 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 		 429 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.87 
 
 		 381 aa  90.9  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 390 aa  90.9  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 378 aa  90.5  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.34 
 
 		 380 aa  90.9  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 378 aa  89  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  24.93 
 
 		 376 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 384 aa  87.4  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  23.55 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.97 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  26.39 
 
 		 387 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  25.61 
 
 		 407 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  24.07 
 
 		 374 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 405 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.04 
 
 		 382 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  27.24 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.98 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 379 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 405 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 405 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  23.63 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  25.22 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.44 
 
 		 365 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  21.82 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  25.89 
 
 		 380 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.49 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>