More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4230 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 375 aa  739    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  41.22 
 
 		 360 aa  259  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 360 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  41.34 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 366 aa  169  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  26.3 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 257 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  25.86 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.81 
 
 		 356 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  25.07 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 413 aa  93.6  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.86 
 
 		 261 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  24.05 
 
 		 366 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.96 
 
 		 373 aa  92.8  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  25.56 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  23.51 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.43 
 
 		 384 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 256 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 373 aa  86.3  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 247 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 249 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  29.74 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  22.66 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  20.59 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  20.32 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.33 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  19.79 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  23.67 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  22.83 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.58 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.22 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  22.02 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.55 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  19.52 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  20 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  21.6 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.38 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 251 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  22.13 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  20.06 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.55 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  33.53 
 
 		 267 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  32.59 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  32.59 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  32.59 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  32.59 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1853  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  20.78 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  22.38 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  21.94 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  20.65 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  22.58 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  22.97 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  22.06 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2507  putative ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.25 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.49 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>