171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3385 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 385 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  56.14 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  41.6 
 
 		 410 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 		 427 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 418 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  27.16 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 430 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  24.94 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  24.67 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  21 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  20.95 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.12 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.79 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.86 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.06 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 241 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24 
 
 		 907 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  21.15 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  21.14 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 376 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  21.47 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  21.47 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  21.47 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  21.47 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 440 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  20.74 
 
 		 369 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  20.3 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 241 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  22.37 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.19 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  24.12 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  23.17 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  25.06 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.94 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  20.76 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  21.17 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 245 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  21 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.76 
 
 		 243 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  20.25 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  24.69 
 
 		 906 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  25.13 
 
 		 376 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.69 
 
 		 906 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  23.87 
 
 		 906 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  29.84 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  20.07 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.32 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  21.92 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  29.84 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  28.1 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  29.84 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.4 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  29.84 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  29.84 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  24.49 
 
 		 691 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  28.64 
 
 		 911 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.82 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.78 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.03 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  23.87 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  24.16 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  24.16 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  25.42 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  24.59 
 
 		 369 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>