53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0216 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  509  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  81.32 
 
 		 257 aa  427  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6993  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.54 
 
 		 396 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  21.97 
 
 		 257 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.99 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.71 
 
 		 377 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 398 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  26.42 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  22.4 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  27.71 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 		 377 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 378 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 385 aa  46.2  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.47 
 
 		 365 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  23.66 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  25.62 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 368 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  22.58 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  24.31 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 449 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 371 aa  43.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.59 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 437 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 366 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  28.27 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>