More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2079 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 269 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  79.07 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  62.98 
 
 		 261 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  59.54 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  58.69 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  62.45 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  52.14 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  57.25 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  52.89 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 241 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  49.01 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  49.21 
 
 		 304 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  53.36 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.87 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  47.3 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  50.4 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  44.81 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  46.24 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.67 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  49.59 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.22 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.07 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.34 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.3 
 
 		 264 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  46.06 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.06 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.28 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  48.26 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  29.8 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 363 aa  98.2  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 339 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 360 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 360 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  32.61 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  31.4 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  32.51 
 
 		 375 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.1 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 367 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.05 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.45 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  28.93 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 358 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  28.94 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.88 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.02 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.15 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  35.38 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.64 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  25 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  25 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  33.17 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.11 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  25.31 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  30.22 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  24.58 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 359 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  25 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  24.58 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.56 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.14 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>