More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2429 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 251 aa  497  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  96.81 
 
 		 251 aa  487  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  56.57 
 
 		 250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  54.07 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  40.19 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 		 360 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 360 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 339 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.05 
 
 		 356 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.77 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2955  hypothetical protein  31.16 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.279885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  26.4 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  27.24 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.99 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 341 aa  72  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.48 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  27.14 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.36 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.23 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  28 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  26.09 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.19 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1161  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  26.46 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.4 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.76 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.4 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1020  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 413 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3252  multidrug ABC transporter permease component  30.56 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3115  hypothetical protein  27.8 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.661432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.88 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.21 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.29 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.94 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0640  ABC-2 transporter component  27.2 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0895  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2743  hypothetical protein  28.37 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  23.04 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  25.13 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  27.6 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>